Selv om de foreløpig ikke anses som truet, synker befolkningen på grunn av flere trusler, inkludert:
* Habitat -tap og fragmentering: Avskoging og landkonvertering for landbruk og utvikling krymper deres habitat.
* jakt og krypskyting: Jaguarer jages etter pelsen, kroppsdelene som brukes i tradisjonell medisin, og noen ganger av frykt eller hevn.
* Human-Wildlife Conflict: Når menneskelige befolkninger vokser, er det flere møter mellom jaguarer og mennesker, noe som fører til konflikter og noen ganger drapet på jaguarer.
Det er viktig å merke seg at jaguarpopulasjoner er svært varierende på tvers av rekkevidden , med noen områder som har mye lavere antall enn andre. Noen befolkninger er kritisk truet, noe som gjør bevaringsinnsatsen avgjørende.