Ja, jaguarer er listet som Nær truet (Near Threatened) av Internasjonal naturvernunion (IUCN).
Selv om de ikke er truede per i dag, er populasjonen på nedgang pga. flere trusler:
* Habitattap og fragmentering: Skogavvirking og arealbruk for landbruk og utvikling.
* Jakt og tyvjakt: Jaktet for pels, kroppsdelar til tradisjonell medisin, eller av frykt.
* Menneske-vilt-konflikt: Økende menneskepopulasjoner fører til flere møter og konflikter.
Jaguarpopulasjoner varierer sterkt over sitt utbredelsesområde; noen populasjoner er kritisk truede, noe som gjør bevaringsarbeid avgjørende.