Kojotter er utrolig tilpasningsdyktige og kan leve i et bredt spekter av økosystemer, mest vanlig:
- Eng: Deres tradisjonelle habitat med åpne jaktområder.
- Skoger: Skogområder som gir skjul for hvile og byttedyr.
- Ørken: Tørre miljøer der de finner vann og jakter.
- Forstads- og byområder: Alltid vanligere nær mennesker pga. mattetilgang.
I utgangspunktet trives kojotter i de fleste habitater med tilstrekkelig byttedyr og skjul.