- Direkte ta: Manater blir noen ganger jaget etter mat, olje og kroppsdeler. De kan også drepes ved et uhell når de blir viklet inn i fiskeutstyr eller båtpropeller.
- Habitat -tap og nedbrytning: Manater er avhengige av grunt, varmt vann med rikelig sjøgress for mat og husly. Ettersom kysthabitater utvikles for bolig- og kommersiell bruk, går disse områdene tapt og forringet, noe som gjør det vanskelig for manater å overleve.
- Vannforurensning: Manater er følsomme for forurensning, som kan komme inn i kroppene deres gjennom inntak eller hudabsorpsjon. Forurensninger som plantevernmidler, gjødsel, olje og kloakk kan forårsake sykdom og død hos manater.
- fartøytrafikk: Manater kan bli slått og drept av båter. De er spesielt sårbare for skader fra store, raskt bevegelige fartøyer, for eksempel lasteskip og hurtigbåter.
I tillegg til disse direkte menneskelige dødsårsakene, påvirkes manater også av klimaendringer, noe som kan forstyrre matforsyningen og gjøre dem mer sårbare for sykdom.