Menneskelige aktiviteter er den viktigste årsaken til manat-dødsfall. Disse inkluderer direkte jakt, uhellmessig uklarring i fiskeutstyr, båt- og propeller-slag, livsmiljøtap og nedverding fra kystutbygging, og vannforurensning fra pesticider, gjødsel, olje og avløpsvann. Klimaendringer påvirker også manater ved å forstyrre fødekilder og øke sårbarhet for sykdommer.