Cairn Terriere lidder ofte av allergier forårsaket av mat, miljøutløsere som pollen og hussmelting, fluer, eller kontakt med visse produkter.
Beste forebygging er å unngå allergenene. Ved matallergi, fjern utløseren fra kosten. Ved miljøallergi, hold hjemmet rent, bruk HEPA-filtre, og unngå høyt pollen-områder. Flueallergiske hunder trenger jevnlig flueforebygging. Ved kontaktallergi, bytt til hypoallergiske stellprodukter.
Hvis din Cairn Terrier viser kløe, nysing, eller vatne øyne, besøk en veterinær for diagnose og behandling.