Habitattap - Den primære årsaken til nedgangen i tuatara-populasjoner i New Zealand er ødeleggelse og endring av deres naturlige habitat. Avskoging, jordbruksutvikling og introduksjon av fremmede arter er alle store bidragsytere til tap av tuatara-habitat.
Rovdyr - Tuataraer er sårbare for rovdyri fra en rekke introduserte rovdyre, inkludert rotter, hermelliner, katter og hunder. Disse rovdyrene kan lett få tilgang til mange tuatara-reirplasser, noe som fører til høye nivåer av reirrovdyr.
Klimaendringer - I tillegg utgjør klimaendringer en betydelig trussel mot tuatara-populasjoner. Stigende havnivå og endrede værmønstre kan direkte påvirke tuatara-reirplasser og matkilder.
Disse faktorene, kombinert med tuataras langsomme vekst og lave reproduksjonsrater, har bidratt til deres truede status. Vernarbeid, som oppdrettsprogrammer i fangenskap og rovdykontroll, er avgjørende for overlevelsen av denne unike arten.