Fruktfluer finnes vanligvis der overmodne eller gjærende frukt og organisk materiale er til stede. Typiske steder inkluderer kjøkken, matbutikker, restauranter, fruktplantasjer, vinerier, komposthauger, og dyreinhegninger.
De reproduksjon raskt, så god sanitasjon og avhending av overmodne frukt hjelper å redusere deres tilstedeværelse.