Keiserpingviner er dyktige jegere i det sørlige havet. Deres kosthold består hovedsakelig av fisk, blæksprut og krill, som de fanger under dypt dyk under antarktisen.
Spesifikke fiskearter som er en del av deres kosthold inkluderer:
- Antarktisk sild (Pleuragramma antarctica)
- Lynfisk (Myctophidae)
- Makrellis (Champsocephalus gunnari)
- Blågrenadier (Macruronus novaezelandiae)
- Patagonsk torsk (Dissostichus eleginoides)
De spiser også blæksprut og krill, som gir essensiell energi for å overleve i ett av jordens mest henværende miljøer.