Akvariumsubstrat er materialet som dekker bunnen av tanken og er like mye en spørsmål om estetisk preferanse som biologisk fordel. Noen akvarister bruker en bunntank (BB) tilnærming, som betyr at de ikke bruker noe substrat.
Grov knust grus
Grov knust grus brukes typisk i lag omtrent 1 tomme dypt. Det er ikke så vanlig som det var tidligere fordi den større størrelsen på gruset tillater at detritus faller mellom mellomrommene, noe som reduserer den positive biologiske effekten av substratet.
Middels korn substrat
Middels korn substrat implementeres i et ganske tynt lag, vanligvis 1 til 2 tommer. Dette gir den biologiske fordelene med substratet uten estetiske ulemper ved noen andre substrattyper.
Levesand
Levesand er sand høstet fra havet. Dens fordel og ulempe er at den inkluderer de levende organismerne som ble høstet sammen med sandet.
Dypt sandbunn
Et dypt sandbunn er et tykt lag sand, vanligvis mellom 2 og 6 tommer dypt. Teoretisk oppmuntrer det tykke sandet biologiske prosesser dyp inne i sandet.
Plenum-system
Et plenum-system er en porøs plattform med sand på toppen. Dette skaper plass mellom sandet og bunnen av tanken hvor næringsstoffer kan synke uten å bygge opp nitrater.