Filippinene er hjemsted for en rekke opprinnelige ferskvannsfisk, inkludert flere barb-arter. Regnbueørret har også blitt introdusert for kommersielle og rekreative formål.
Opprinnelige arter inkluderer
- Plettet barb (Puntius binotatus): Funnet i elver, bekker og fjellinnsjøer.
- Opprinnelig barb (Puntius sp.): Kjent lokalt som «dalag», funnet i fjellbekker.
- Mindoro barb (Puntius sealei): Endemisk for Mindoro-øya.
- Palawan barb (Puntius palata): Funnet i Palawans elver og bekker.
- Malabar rød barb (Puntius filamentosus): Introdusert og funnet i ferskvannsforekomster.
- Rødstjert børstebarb (Puntius erythromicron): Opprinnelig i Filippinenses elver og bekker.
Andre opprinnelige ferskvannsarter inkluderer gulllabergomami, plettet knivfisk, stor gourami, og ville engelfiskpopulasjoner.