Alligator-habitat varierer etter art:
- Amerikansk alligator: Ferskvannssumper, elver, innsjøer og myrer i søroverlegene USA.
- Kinesisk alligator: Ferskvannshabitater i Øst-Kina, spesielt Yangtze-elvens bassineng.
- Svart kaiman: Ferskvannsvåtmarker, elver og innsjøer i Sør-Amerika.
- Amerikansk krokodille: Kystvåtmarker, elver og estuarier i Nord-, Midt- og Sør-Amerika.
- Sjøkrokodille: Kysthabitater, estuarier, mangrove og brakkvann i Sørøst-Asia og nordlige Australia.
Alligatorer foretrekker grunne, vegetasjonsrike vann og bygger reir på elve- eller innsjøbredder. De er halvakvatiske og soler seg på land.