Pingviner står overfor flere naturlige rovdyre, både i vannet og på land.
Leopardsseler er blant de mest farlige, de bruker sin hastighet til å fange pingviner i havet. Kvaler jakter også pingviner, ofte i flokker for å drepe selv store fugler.
Pelseseler og sjøløver rovder noen ganger mindre pingviner, mens visse haier, inkludert hvitheier og tigerhaier, er kjent for å spise dem også.
På land eller nær hekkekolonier kan fugler som skuer og stormpetreller målrette egg, unger eller sårbare voksne.