Aguti-rovdyr varierer etter region, men vanlige inkluderer jaguarer, ocelotter, og andre kattedyr; ulver, prairieulver, og reven; vaseler, skunk, og tayra; ørner, høker, og ugler; store slanger som boa og anaconda; krokodiller nær vann; og villsvin. Agutier bruker smidighet og tett vegetasjon som tilflukt, men deres populasjoner påvirkes av rovdyretall.