Antarktis har relativt få arter på grunn av ekstreme forhold, og få er kritisk truet globalt. Likevel er noen antarktiske arter listet som sårbar eller nærmest truet av bevaringsorganisasjoner. Eksempler inkluderer kejserpingvin (Near Threatened), antarktisk blåhval (Endangered) og Ross Sea-tannfisk (Vulnerable). Klimaendringer, istap og overfiske er hovedbekymringer. Det nøyaktige antallet varierer etter organisasjon og kriterier.