Stor hornugle er en toppredator med få naturlige fiender, men noen arter er kjent for å jekte på den:
- Steinørn: Store, kraftige rovfugler som jakter ved å svale og dykke for å fange bytte, inkludert store hornugler.
- Duehauk: Smidige skogjegere som angriper bytte fra tre-topper.
- Lappugle: Kraftige ugler som jakter stille gjennom skogen og kan jekte på store hornugler.