Hvithodeørner er opportunistiske rovfugler som først og fremst erner seg av fisk, men vil også spise små pattedyr, fugler og reptiler.
De jakter typisk tidlig på morgenen eller sent på ettermiddagen, svermer over vann og dykker for å gripe byttedyr med klørne sine. Favorittfisk inkluderer laks, ørret og havabbor. De kan også stjele fisk fra andre fugler.
I tillegg til fisk spiser de kanin, ekorn, munk, and, gås, måke, slange og skilpadde. De vil spise hva som helst byttedyr som er tilgjengelig.