Kolibrier kan være verter for en rekke parasitter, inkludert protozoer, bakterier, sopp, virus, og ektoparasitter som fluer, lus, midd og flått. Endoparasitter som ormer kan også påvirke dem.
Vanlige problemer inkluderer fuglemalaria, trikomonose, salmonellose, og aspergillose. Ikke alle kolibrier får parasitter, og alvorlighetsgraden varierer. Hvis du mistenker at en kolibri har parasitter, konsultera en veterinær.