Rovdyr
- Fugler: Hegrer, silkehegrer, isfugler, og andre vadefugler predere på mudskippere i og utenfor vannet.
- Reptiler: Varaner, slanger, og noen skilpadder kan være trusler.
- Pattedyr: Oter og noen aper kan spise mudskippere hvis de får sjansen.
- Andre fisk: Større fisk som kommer inn i deres habitat kan predere på dem.
Mudskippers Forsvar
Mudskippere har sterkt, slimete hud og kan grave seg raskt ned i mora for å rømme rovdyere.