Svarthale præriehund er først og fremst herbivorer, med gress og urter som utgjør majoriteten av kosten. Gress spises hele året, mens blomsterplaneter (urter) er viktigere om våren og sommeren.
De spiser også insekter som gresshoppere, biller, myrer og møller, spesielt om sommeren og høsten når insekter er rikelig. Bær og frø, inkludert bær, plommer, kirsebær og solsikkefrø, spises sesongmessig eller gjennom hele året.
Dette varierte kostgir de næringstoffene præriehund trenger for å vokse og reprodusere seg, og tilgjengelighet av mat påvirker sterkt hvor de lever og hvor mange som overlever i et område.