denaturering :Etter døden brytes de biologiske strukturene som opprettholder proteinkonformasjon, noe som får proteiner til å miste sin opprinnelige struktur og bli denaturert. Denne prosessen gjør proteiner mer utsatt for kjemiske forandringer og enzymatisk nedbrytning.
proteolyse :Enzymer som kalles proteaser, som er til stede i vevene i den døde organismen og produsert av mikroorganismer, begynner å dele ned proteiner i mindre peptider og aminosyrer. Denne prosessen er kjent som proteolyse.
Autolyse :Autolyse er selvfordeling av vev på grunn av frigjøring av endogene enzymer fra cellene. Disse enzymene nedbryter cellulære komponenter, inkludert proteiner, til mindre molekyler.
Bakteriell nedbrytning :Bakterier og andre mikroorganismer som er til stede i miljøet, bidrar til nedbrytning av proteiner. De produserer forskjellige enzymer som kan bryte ned proteiner og bruke dem som en kilde til næringsstoffer. Bakteriell nedbrytning fører til dannelse av en rekke produkter, inkludert aminosyrer, peptider og ammoniakk.
PutRefaction :PutRefaction er nedbrytningen av proteiner av visse bakterier som produserer foul-luktende forbindelser som hydrogensulfid, ammoniakk og aminer. Denne prosessen er ofte assosiert med nedbrytning av dyrekadaver.
deaminering :Deaminering er fjerning av aminogrupper fra aminosyrer. Det kan skje gjennom enzymatiske reaksjoner eller ikke-enzymatiske prosesser. Deaminering resulterer i frigjøring av ammoniakk og dannelse av ketosyrer.
dekarboksylering :Dekarboksylering er fjerning av karboksylgrupper fra aminosyrer. Det katalyseres typisk av enzymer kjent som dekarboksylaser. Dekarboksylering fører til produksjon av aminer og karbondioksid.
Dannelse av Advanced Glycation End Products (AGE) :Over tid kan proteiner gjennomgå ikke-enzymatiske reaksjoner med sukker, noe som fører til dannelse av aldre. Alder er stabile forbindelser som akkumuleres i vev og er involvert i aldring og forskjellige sykdommer.
Disse kjemiske endringene resulterer i nedbrytning av proteiner og frigjøring av enklere nitrogene forbindelser og andre molekyler. Prosessen med nedbrytning fører til slutt til resirkulering av næringsstoffer tilbake i miljøet, og bidrar til de biogeokjemiske syklusene av elementer.