Respiratorisk system: Nebbdyret har små men høyt vaskulariserte lunger for effektiv gassutveksling. Det har også spiracula på toppen av hodet som kan åpnes og lukkes for å puste luft eller forhindre vanninngang under svømming.
Fordøyelsessystem: Magen har to kamre – en forgamme for lagring og myking, og en gjertelmage for fordøyelse. Korte tarmer tillater rask passasje av mat.
Nervsystem: Koordinerer bevegelse, kroppstemperatur og sanselig behandling. Nebbdyret har en relativt stor, organisert hjerne og sensitive øyne og nese.
Sirkulasjonssystem: Nebbdyret har to hjerter – et pumper oksygenert blod til vev, og det andre pumper deoksygenert blod til lungene. Denne ordningen ligner på amfibier og reptiler.
Samarbeid: Disse systemene opprettholder homeostase. Respiratorisk system trekker ut oksygen, fordøyelsessystem trekker ut næringsstoffer, nervsystem koordinerer bevegelse og sanser, og sirkulasjonssystemet distribuerer oksygenert blod.