Alle slangearter skifter skinn jevnlig; dette kan også kalles muddring eller ecdysis. Unge ballpytoner kan skifte skinn hver few uker fordi de vokser raskt, og voksne ballpytoner kan bare skifte skinn hver few måneder. Noen ballpytoner kan også skifte skinn fordi huden er irriterte på grunn av skadedyr, eller for å helbrede et snitt eller skrapsår. Skifting er en helt normal handling, og avhengig av om slangen er i god helse og holdes under riktige forhold, kan det avskilte skinnet komme av i ett stykke eller i mange stykker.
Tap av appetitt
Ballpytoner som er i ferd med å skifte skinn eller allerede er i skifting kan ikke virke interessert i å spise og kan nekte mat. Hvis dette skjer, er det bare midlertidig; ballpytonen bør ha en normal appetitt etter skifting.
Fargeendring
En ballpython som er i ferd med å skifte skinn kan virke mer matt i fargen samt virke som om den har melkefargete eller blåaktige belægninger på øyet. Ballpytonen skifter hele skinnen sin, inkludert det tynde laget som dekker øyene. Denne fargeendringen er bare det gamle skinnet som skiller seg fra det nye skinnet, og slangen forbereder seg på å skifte det.
Bad
Ballpytoner krever høyere mengder luftfuktighet og fuktighet for å skifte skinn ordentlig. For å oppnå dette, kan ballpytoner senke seg selv og bade i vannskålen i timer.
Avskalling av hud
Det endelige symptom på en skiftende ballpython er den faktiske handlingen av skifting. Det gamle skiftede skinnet kan være krøllet rundt bunnen av slangen, som om den kryser ut av en sokk. Alternativt, hvis ballpytonen ikke har de nødvendige luftfuktighetsnivåene for en korrekt skifting, kan det avskilte skinnet flakke av i stykker.