Best overall
Tilapia: Hardhudde, raskvoksende, og tolerante for ulike vannforhold. De gir gode fileter men kan være invasive, så forhindre rømning.
Malm: Kanalmalm og afrikansk malm er hardhudde, raskvoksende, og relativt enkle å oppdrette med sterke immunsystemer.
For nybegynnere
Guldfisk: Populære, rimelige, og tolerante, men de trenger plass og produserer betydelig avfall.
Koi: Pyntfisk som trives i akvaponikk, men krever større tanker og varmere temperaturer.
For mindre systemer
Guppy: Små, fargerike, raske oppdrettere som er enkle å pleie i kompakte systemer.
Zebrafisk: Energetiske stripete fisk som tjener som gode vannkvalitetsindikatorer.
Andre overveielser
Tilpass fisk til ditt klimas vann temperatur, systemstørrelse, og ønsket vekstrate. Forsk alltid artskompatibilitet, overvåk vannparametere (pH, ammoniak, nitritt, nitrat), og velg et systemdesign som passer din fisk. Sjekk lokale reguleringer før du velger art.