Mens den eksakte evolusjonshistorien fremdeles blir undersøkt, mener forskere at platypus utviklet seg fra en felles stamfar med andre monotremer (eggleggende pattedyr) som bodde i superkontinentet gondwana For over 100 millioner år siden.
Da Gondwana brøt fra hverandre, ble Australia isolert, slik at platypus kunne utvikle seg i relativ isolasjon, og utviklet sine særegne trekk.