- Skog:Flaggermus er vanlig i skog i hele staten, hvor de henter i trær og jakter på insekter.
- Grotter:Flaggermus henter også i huler, som gir dem et mørkt, fuktig miljø som er ideelt for å oppdra sine unge.
- Gruver:Forlot gruver er et annet populært roost -sted for flaggermus, ettersom de tilbyr lignende forhold som huler.
- Bridges:Noen flaggermusarter, for eksempel den meksikanske fritt-tailed flaggermus, roost under broer.
- Bygninger:Flaggermus kan også finnes i bygninger, der de kan hente på loft, vegger eller andre skjermede områder.
Totalt sett finnes flaggermus i hele North Carolina og kan tilpasse seg en rekke naturtyper.