Gaupens fordøyelsessystem ligner på andre rovdyr:
- Munn: Skarpe tenner revner og males kjøtt.
- Strup: Transporterer mat til magen.
- Mage: Rører maten og utskiller syrer og enzymer.
- Tyndtarmen: Absorberer mesteparten av næringsstoffer gjennom villa.
- Tykkttarmen: Absorberer vann og lagrer avfall.
- Endearmen: Utskiller avfall.
Dette systemet er godt tilpasset for å fordøye animalske proteiner og fedtter.