* rovdyr: Hvalhaier har få rovdyr, men de blir noen ganger byttet av killerhval, flotte hvithaier og tigerhaier.
* sykdom: Hvalhaier kan lide av en rekke sykdommer, inkludert bakterieinfeksjoner, virusinfeksjoner og parasittiske angrep.
* Habitat -tap: Hvalhaier er avhengige av sunne korallrev og andre marine naturtyper for å overleve. Imidlertid blir disse naturtypene stadig mer truet av menneskelige aktiviteter, som forurensning, kystutvikling og klimaendringer.