Forsuring av havet er en alvorlig trussel mot flaskenesedelfiner, da det kan forstyrre deres evne til å ekkolokalisere, kommunisere og jakte på mat. Reduserte pH-nivåer i vannet kan også endre delfinenes byttedyr, og påvirke hele økosystemet.
De langsiktige implikasjonene av havforsuring for flaskenesedelfiner og andre marine arter er komplekse og usikre, og krever vedvarende forskning og aktiv bevaringsinnsats for å redusere virkningene.