Phycoerythrin virker rødt fordi den absorberer lys for det meste i den blågrønne regionen av spekteret (topper rundt 495 nm bølgelengde) og reflekterer rødt lys. Dette pigmentet spiller en rolle i fotosyntesen ved effektivt å fange lysenergi fra den blågrønne delen av spekteret og overføre det til klorofyll A, det primære fotosyntetiske pigmentet. Ved å maksimere lysabsorpsjon tillater phycoerythrin alger å fotosyntetisere effektivt i dypt vann eller skyggefulle miljøer der blågrønn lys trenger inn rimelig godt.
Sammen med phycoerythrin, bidrar også andre phycobiliproteiner som phycocyanin (virker blå) og allofycocyanin (virker blågrønn) til de livlige fargene observert i forskjellige algarter.