Kirurgefisk er byttedyr for en rekke forskjellige rovdyr:
- Større fisk: Hvitting, snapper, moray-ål og noen haier
- Pattedyr: Delfiner og noen seler
- Fugler: Sjøfugler som fregattfugler og suler
Mindre kirurgefisk er mer sårbare. Lokasjon, defensive halestinger og skoleadferd påvirker risikoen. Rovdyrenes diett varierer etter tilgjengelighet og årstid.