Longhorn-storfe har den mest variable pelsfargen av alle storferaser i verden. I motsetning til de hvithodet mørke røde Herefords eller den stereotypiske svart-hvite pirkete Holstein, kan longhorns ha nesten enhver kombinasjon av farger, mønster og merker. Denne variabiliteten gjør avl av longhorns for et bestemt utseende til en vanskelig oppgave. Selv om andre trekk ved longhorn-storfe, f.eks. horne lengde, kan påvirkes av miljøet, er farge utelukkende avhengig av genetikk.
Farger
Longhorn-storfe kommer i nesten enhver farge – brun, rød, svart, gul og til og med farger kalt ringstreaked eller mulberry blue (mulberrblå). Hvit funnet på longhorns kan være lys eller et dempet krem. Longhorns kommer også i mange nyanser av brun, fra rik mørk sjokolade til lys faun. Storfe av longhorn-varietet med en utdusjet kremfarget pels kalles grullas etter fargen på sandkranichen.
Mønstre
Noen raser av storfe er pirkete eller flekkete og noen er bringet (brindled), men longhorn-storfe kommer i mange mønstre. Noen er bringet, ut som den walisiske Corgi-hunden. Noen er sprinklet (speckled), andre streket (streaked), mens andre er pirkete (peppered) med kontrasterende farger. Noen longhorns er en solid farge med få merker. Det er ikke uvanlig å se svarte longhorn-storfe med en svart-pirket hvit flakk på rumpe, mye som Appaloosa-hester. Mange longhorns har en mørk linje ned midten av ryggen eller en ring av lysere farge rundt munnene sine.
Genetikk
Longhorn-storfe farge bestemmes av to pigmenter – svart og rødt. Det svarte pigmentet, Eumelanin, forårsaker svart til grå farging, avhengig av hvor høy eller lav konsentrasjonen av pigmentet er. Phaeomelanin, det røde pigmentet, kan forårsake mørk rød til lys gul, avhengig av konsentrasjonen. Når gener som styrer fargen ikke utløser verken det svarte eller røde pigmentet, er pelsfargen hvit på det området. Blandinger av disse to pigmentene og ingen pigment i ulike områder av longhorns kropp produserer den nesten uendelige variasjonen av farger og mønstre.
Avl
Noen longhorn-storfe avlere mener at avl av longhorns for et bestemt utseende er nært umulig, ifølge doublehelixranch.com. Paring av en solid svart okse med en solid svart ku resulterer ofte i et kalv med en helt annen farge eller en kombinasjon av andre farger. Fordi longhorn-storfe har åtte ulike fargestyrede gener, er det over 26 000 kombinasjoner av mulige genotyper. Dette gir longhorn en vesentlig sjanse for svært variabel fargelgging.